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La qualità dell'acqua può essere distinta in due categorie, vale a dire la qualità dell'acqua microbica e chimica. Queste due caratteristiche sono comunque strettamente collegate l'una all'altra. La qualità microbica dell'acqua è determinata dall'organismo vivente. Sebbene l'acqua del rubinetto contenga un basso numero di batteri, la pressione microbica sul capezzolo della bevanda può essere enormemente elevata attraverso un sistema idrico contaminato. Attraverso il sistema di acqua potabile, gli organismi patogeni sono eccellenti nel trasportare un'infezione da animale a animale. La portata della qualità microbica nell'acqua potabile va oltre la sola acqua, è molto importante che anche il sistema di tubazioni sia pulito. La qualità chimica comprende molecole come ferro, manganese, calcio e magnesio, in cui gli ultimi due determinano in gran parte la durezza dell'acqua. Troppi minerali causano precipitazioni nei tubi che possono causare perdite. La precipitazione è anche un terreno ideale per i microrganismi che formano il biofilm. Due minerali che meritano un'attenzione particolare sono il ferro e il manganese. Il ferro da solo, in concentrazioni normali, non è dannoso per i maiali da consumare tramite acqua potabile. Può tuttavia depositarsi all'interno delle linee dell'acqua per la presenza di ossigeno, in cui il ferro solubile si converte in ferro insolubile. Il colore dell'acqua è principalmente causato dalla presenza di ferro. Anche il manganese non è dannoso per il maiale nelle concentrazioni in cui è normalmente presente nell'acqua. Può causare sedimenti neri nelle linee d'acqua, specialmente quando il flusso d'acqua è basso. Elevati livelli di ferro e manganese possono causare differenze nel sapore dell'acqua e possono causare disturbi del tratto gastrointestinale. Si depositerà sulla parete interna delle linee d'acqua, creando un ambiente adatto per l'attaccamento dei microbi e successivamente la formazione di biofilm, ovvero una comunità strutturata di microrganismi racchiusi in una matrice polimerica autoprodotta che è attaccata ad una superficie. Il biofilm può danneggiare l'attrezzatura dell'acqua, dare odore e sapore sgradevole all'acqua e può diffondere malattie attraverso la mandria.
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