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Estados Unidos: detectadas nuevas cepas de PEDV en cerdos

Secuencias PEDV S1 de 5 casos sólo tienen 93,9 a 94,6% de identidad de nucleótidos con las cepas PEDV identificadas previamente en cerdos de los Estados Unidos.

6 febrero 2014
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De acuerdo con informaciones publicadas por la AASV, el Laboratorio de Diagnóstico Veterinario de la Universidad Estatal de Iowa (ISU-VDL) está ofreciendo la secuenciación PEDV S1 a sus clientes para ayudar a determinar la relación genética y epidemiología del PEDV en los cerdos en Estados Unidos. Entre el 24 a 29 de enero la secuenciación PEDV S1 se realizó sobre 15 casos de PEDV y se observaron 10 casos similares entre sí y a las cepas identificadas desde abril de 2013 (99,1 a 100 % de identidad de los nucleótidos), por contra, las secuencias PEDV S1 de los otros 5 casos restantes sólo mostraron una identidad de los nucleótidos del 93,9 a 94,6% con las cepas del PEDV identificadas previamente. Sin embargo, estos 5 casos de PEDV compartían entre ellos una identidad de los nucleótidos del 99,6 a 100 % sobre la base de las secuencias S1.

El análisis filogenético basado en las secuencias S1 mostró que los mencionados 5 casos de PEDV se agrupan de manera muy diferente a las cepas PEDV previamente identificadas en los Estados Unidos. Sobre la base de datos disponibles en la actualidad parece poco probable que esta cepa sea una mutación evolucionada a partir del PEDV identificado previamente. La determinación de la totalidad de las secuencias del genoma de estos nuevos PEDVs está en progreso y ayudará a determinar el origen de los virus .

Viernes, 31 de enero de 2014/ AASV/ Estados Unidos.
http://www.aasv.org

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