Estudio de asociación de todo el genoma para caracteres relacionados con la productividad de cerdas Landrace
J.H.Kang, E.A.Lee, S.H.Lee, S.H.Kim, D.H.Lee, K.C.Hong, H.B.Park. Genome-wide association study for sow lifetime productivity related traits in a Landrace purebred population. Livestock Science. Volume 202, August 2017, Pages 21-24. https://doi.org/10.1016/j.livsci.2017.05.013
12-jun-2018 (hace 6 años 6 meses 10 días)La mejora de la productividad de la cerda durante su vida productiva (SLP, por sus siglas en inglés) puede aumentar el rendimiento y la rentabilidad de la explotación. Existen genes y factores ambientales que influyen en estos caracteres complejos. Para identificar los loci de caracteres cuantitativos y genes candidatos posicionales para los caracteres relacionados con la SLP, se realizó un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) usando 656 cerdas de raza pura Landrace de una granja de cría comercial. Todas las cerdas de la población de estudio se genotipificaron con Illumina Porcine SNP60 BeadChip y se realizó el GWAS mediante análisis de asociación lineal basado en modelos de efectos mixtos utilizando el programa GCTA.
Se identificaron cinco marcadores sugestivos de polimorfismo de un solo nucleótido para el genoma total para el total de lechones nacidos vivos y paridad final en el total de la vida productiva. Estos cinco marcadores estaban altamente asociados con otros caracteres relacionados con SLP, y todos ellos se encontraban dentro o cerca de un gen particular, el MEGF11, en el cromosoma 1.
Este nuevo gen candidato posicional podría contribuir a aumentar la productividad de la cerda a los largo de su vida productiva después de la validación en otras poblaciones.