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La elevada diversidad genética del virus de PRRS puede tener serias implicaciones en el desarrollo de nuevas vacunas. Así pues, la inmunidad inducida por una cepa vacunal puede proteger sólo de forma parcial, dependiendo el nivel de protección de las características inmunológicas y de la variabilidad a nivel genético de las cepas vacunal e infectiva. La complejidad de la respuesta inmune frente al PRRSV y su capacidad para escapar o modular el sistema inmune del huésped hacen difícil, hasta el día de hoy, desarrollar una vacuna que pueda ser usada para erradicar la enfermedad. Dicha vacuna debería cumplir al menos 4 requisitos: eficacia, universalidad, seguridad y capacidad para diferenciar animales vacunados de infectados.
Además, debido a las variabilidades genéticas e inmunológicas de las cepas de este virus, los estudios dirigidos a demostrar la eficacia de una vacuna deberían incluir desafíos con más de una cepa de características diferenciadas. En la siguiente tabla se resumen algunas de los conocimientos ya conocidos o requeridos para desarrollar nuevas vacunas más efectivas.
Tabla 1. Algunas de las características conocidas, asumidas y desconocidas de la respuesta inmune en la infección por PRRSV, relevantes para el desarrollo de vacunas.
| Conocido | Asumido/supuesto | Aún desconocido | |
| Anticuerpos neutralizantes (AN) | GP5, GP4 | M, GP3 (?) | |
| Papel de AN en protección | La transferencia pasiva protege frente al desafío | Papel exacto de los AN en infección natural | |
| Epítopos de células T | Se han descrito respuestas de las células T a polipéptidos individuales | Varias proteínas víricas contienen epítopos de células T | Juego completo de epítopos críticos de las células T |
| Inmunidad mediada por células | Las frecuencias de células productoras de IFN-γ están correlacionadas con la protección frente al desarrollo de viremia en lechones | IFN-γ podría mediar inmunidad esterilizante | Requerimiento preciso de células productoras de IFN-γ para protección |
| Modulación de la respuesta inmune | PRRSV contiene un epítopo de distracción en la GP5 | El epítopo de distracción retrasa el desarrollo de AN | |
| Ciertas cepas de PRRSV pueden inhibir IFN-α | La falta de IFN-α y la liberación de IL-10 retrasarían la respuesta mediada por células | Proteínas víricas o mecanismos por los que se inhibe IFN-α o se induce IL-10 | |
| Ciertas cepas de PRRSV pueden inducir liberación de IL-10 | |||
| Diversidad genética | Elevada diversidad genética dentro de cada genotipo | La diversidad genética podría estar relacionada con las características inmunopatológicas de cepas del PRRSV | Cómo se correlaciona la diversidad genética con la virulencia o propiedades inmunológicas de cepas de PRRSV |
| La diversidad genética afecta a la eficacia de la vacuna | |||
| Proteínas esenciales y no esenciales | Las proteínas estructurales parecen ser principalmente esenciales | Algunas de las proteínas no estructurales podrían ser no esenciales | Mapa exacto de proteínas esenciales y no esenciales |
| Algunas de las proteínas no estructurales pueden sufrir deleciones naturales |
