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Se observaron regiones específicas de cepa, reagrupamientos y alteraciones en las secuencias de adhesión entre las dos cepas de M. hyopneumoniae, todas ellas potencialmente relacionadas con la patogenicidad. Se advirtieron asimismo diferencias en el tamaño del genoma, que implicaban pérdida de vías metabólicas redundantes, con mantenimiento de rutas alternativas en diferentes especies. También se observó transferencia horizontal de genes entre M. synoviae y M. gallisepticum.
ATR Vasconcelos et al. Swine and Poultry Pathogens: the Complete Genome Sequences of Two Strains of Mycoplasma hyopneumoniae and a Strain of Mycoplasma synoviae. 2005. Journal of Bacteriology. Vol. 187(16):5568-5577
