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Análisis de dos QTL epistáticos en el cromosoma 12 porcino para el carácter tamaño de camada

16 septiembre 2009
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Un estudio anterior relacionado con la detección de QTL para los caracteres número de lechones nacidos totales (NT) y nacidos vivos (NV) realizado en un cruce experimental tipo F2 Ibérico x Meishan mostró la complejidad de estos caracteres detectando varios QTL y múltiples interacciones epistáticas entre ellos en los cromosomas porcinos 1, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 15 y 18, siendo uno de los resultados más relevantes la detección de dos QTL epistáticos en el cromosoma 12 para NV y NT. El presente estudio tuvo como objetivo confirmar estos dos QTL epistáticos mediante la incorporación de nuevos marcadores y analizar dos genes previamente seleccionados como candidatos posicionales y biológicos (SLC9A3R1 y NOS2a). Se genotiparon 12 marcadores en todo el cruce: 7 microsatélites (SW2490, SW2494, SW1307, SW874, SW1956, S0106 y SWR1021), 3 nuevos microsatélites (SWR1802, S0090 y SW1962), y dos marcadores PCRRFLP (GH (Hha I) y FASN (Msp I)).

La detección de QTL con estos 12 marcadores reveló la presencia de dos QTL sugestivos en SSC12 para NV y NT que se tornaron significativos cuando se testó la interacción epistática (QTL1 a 15cM y QTL2 a 97cM), siendo aditivo x aditivo la interacción más significativa (p<0.0005 para NV y p<0.0006 para NT). Estos resultados confirman lo detectado previamente por Noguera et al. (2009) pero con un mayor poder estadístico y significación debido a la incorporación de 5 nuevos marcadores. Para NV, los 3 polimorfismos de NOS2a tuvieron efectos aditivos significativos sobre el carácter, mientras que para SLC9A3R1 sólo el SNP c.1359A>G mostró efectos significativos. En el caso del carácter NT sólo los SNPs SLC9A3R1 c.1359A>G y NOS2a c.2192C>T, presentaron efectos significativos.

Fernández-Rodríguez, A., Rodríguez, M.C., Noguera, J.L., Balcells, I., Óvilo, C. y Fernández, A.I. Análisis de dos QTL epistáticos en el cromosoma 12 porcino para el carácter tamaño de camada. Acteon. Comunicación Aida 2009.

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