Sensibilidad y especificidad y coste de la PCR para PRRSV en muestras individuales y combinadas de suero
B. Carmichael; D. Polson; D. Holtkamp. The impact of pooling piglet serum samples on PRRSv PCR performance in sow herds being monitored for time-to-negative interval. 2010 AASV Annual Meeting: Implementing Knowledge: 67-70.
09-jul-2010 (hace 14 años 5 meses 11 días)La utilización de la PCR se muestra muy efectiva para el control del PRRSV si bien es relativamente cara. Teniendo en cuenta que la utilización de pools de muestras puede reducir el costo, los objetivos de este trabajo fueron evaluar la sensibilidad y la especificidad de la PCR para PRRSV en muestras combinadas de suero, tanto a nivel de pool de muestras como de explotación utilizando un tamaño de muestra fijo.
El estudio se realizó en dos explotaciones negativas de 5000 madres que experimentaron una introducción de un tipo salvaje del PRRSV en la primavera de 2008. Se puso en marcha un plan de eliminación utilizando PCR de muestras de lechones. Se tomaron muestras de 120 lechones a destetar (60 muestras por explotación) que fueron analizadas individualmente de forma mensual hasta que la prevalencia del PRRSV disminuyó por debajo del 20-30%, momento en el que se tomaron nuevamente 120 muestras que fueron analizadas de forma semanal individualmente o en pools 5:1 y 10:1 durante seis semanas consecutivas. El pool o la explotación se consideró verdaderamente positiva cuando una o más de las muestras individuales contenidas en el pool o a nivel de explotación sea positivas (pool = 5:1 o 10:1; explotación = 60 muestras).
La sensibilidad a nivel de pools fue del 84,5% para 5:1 (95% IC = 73,5% - 91,6%, n = 274 pools) y del 82,0% para 10:1 (95% IC = 68,1% - 91,0%, n=137 pools). Para el escenario 5:1 había una disminución relativa de la sensibilidad de hasta el 27% mientras que para 10:1 fue del 32%. En relación con la especificidad, esta fue del 99,0% para 5:1 y del 97,7% para 10:1. El nivel de sensibilidad y la especificidad de la explotación fueron del 100% para ambos grupos 5:1 y 10:1. Se utilizó también un modelo estocástico de simulación para comparar el nivel de sensibilidad de tres posibles escenarios (10:1, 5:1 y 1:1) a bajos niveles de prevalencia (5%, 3% y 1%) siendo la sensibilidad para los pools 10:1 (85,2%, 69,6% y 32,9%, respectivamente) superior a las 5:1 (80,4%, 63,6% y 27,0 %) y a las muestras individuales (55,3%, 37,9% y 14,8%).
Estos resultados sugieren que se puede obtener una estimación más precisa, cuando el TTNP es importante para la toma de decisiones, aumentando tanto el tamaño de la muestra (hasta aproximadamente 60) como el tamaño de los pools (hasta 10:1), mejorando así el nivel de detección de la PCR para un costo similar.
El estudio se realizó en dos explotaciones negativas de 5000 madres que experimentaron una introducción de un tipo salvaje del PRRSV en la primavera de 2008. Se puso en marcha un plan de eliminación utilizando PCR de muestras de lechones. Se tomaron muestras de 120 lechones a destetar (60 muestras por explotación) que fueron analizadas individualmente de forma mensual hasta que la prevalencia del PRRSV disminuyó por debajo del 20-30%, momento en el que se tomaron nuevamente 120 muestras que fueron analizadas de forma semanal individualmente o en pools 5:1 y 10:1 durante seis semanas consecutivas. El pool o la explotación se consideró verdaderamente positiva cuando una o más de las muestras individuales contenidas en el pool o a nivel de explotación sea positivas (pool = 5:1 o 10:1; explotación = 60 muestras).
La sensibilidad a nivel de pools fue del 84,5% para 5:1 (95% IC = 73,5% - 91,6%, n = 274 pools) y del 82,0% para 10:1 (95% IC = 68,1% - 91,0%, n=137 pools). Para el escenario 5:1 había una disminución relativa de la sensibilidad de hasta el 27% mientras que para 10:1 fue del 32%. En relación con la especificidad, esta fue del 99,0% para 5:1 y del 97,7% para 10:1. El nivel de sensibilidad y la especificidad de la explotación fueron del 100% para ambos grupos 5:1 y 10:1. Se utilizó también un modelo estocástico de simulación para comparar el nivel de sensibilidad de tres posibles escenarios (10:1, 5:1 y 1:1) a bajos niveles de prevalencia (5%, 3% y 1%) siendo la sensibilidad para los pools 10:1 (85,2%, 69,6% y 32,9%, respectivamente) superior a las 5:1 (80,4%, 63,6% y 27,0 %) y a las muestras individuales (55,3%, 37,9% y 14,8%).
Estos resultados sugieren que se puede obtener una estimación más precisa, cuando el TTNP es importante para la toma de decisiones, aumentando tanto el tamaño de la muestra (hasta aproximadamente 60) como el tamaño de los pools (hasta 10:1), mejorando así el nivel de detección de la PCR para un costo similar.