Cambios en la secuencia de nucleótidos del PCV2 en Dinamarca
Dupont K, Nielsen EO, Bækbo P, Larsen LE. Genomic analysis of PCV2 isolates from Danish archives and a current PMWS case-control study supports a shift in genotypes with time. Vet Microbiol. 2007. Article in press. doi:10.1016/j.vetmic.2007.09.016
18-feb-2008 (hace 16 años 9 meses 10 días)Teniendo en cuenta que el circovirus porcino tipo 2 (PCV2) puede detectarse tanto en explotaciones afectadas por el síndrome del desmedro (PMWS) como en explotaciones libres de la enfermedad, el objetivo de este estudio fue determinar si era posible agrupar las secuencias de nucleótidos de los aislados del PCV2 procedentes de ambos tipos de explotaciones en dos clusters filogenéticamente diferenciados.
Todos los aislados analizados (45), procedentes todos ellos de explotaciones danesas, pertenecían al PCV2-grupo 1 con una identidad de la secuencia de nucleótidos del 99,4-100%, lo que indicaba una población de PCV2 muy homogénea en Dinamarca. El análisis filogenético de los aislados no dio como resultado la presencia de clusters diferentes para los aislados procedentes de granjas afectadas y no afectadas por la enfermedad. Por otro lado, el hecho de que los aislados analizados en este estudio (aislados entre 2003/2004) pertenecieron al PCV2-grupo 1 condujo a pensar que posiblemente había habido cambios en la secuencia de nucleótidos del PCV2 en Dinamarca ya que todos los aislados del PCV2 anteriores al primer brote de PMWS (2001) pertenecían a un nuevo grupo PCV2 identificado por primera vez en este estudio y nombrado como PCV2-grupo 3 (aislados en 1980, 1987 y 1990) o bien al PCV2-grupo 2 (aislados en 1993 y 1996). El cambio de PCV2-grupo 2 a 1 fue confirmado a una escala más global utilizando datos del GenBank desde el año 1997 a 2006. El análisis mostró que el cambió tuvo lugar en el año 2003 o antes. Esto podría ser indicativo que el PCV2-grupo 1 es una forma adaptada del PCV2-grupo 2 y posiblemente podría ser más patógeno.
Todos los aislados analizados (45), procedentes todos ellos de explotaciones danesas, pertenecían al PCV2-grupo 1 con una identidad de la secuencia de nucleótidos del 99,4-100%, lo que indicaba una población de PCV2 muy homogénea en Dinamarca. El análisis filogenético de los aislados no dio como resultado la presencia de clusters diferentes para los aislados procedentes de granjas afectadas y no afectadas por la enfermedad. Por otro lado, el hecho de que los aislados analizados en este estudio (aislados entre 2003/2004) pertenecieron al PCV2-grupo 1 condujo a pensar que posiblemente había habido cambios en la secuencia de nucleótidos del PCV2 en Dinamarca ya que todos los aislados del PCV2 anteriores al primer brote de PMWS (2001) pertenecían a un nuevo grupo PCV2 identificado por primera vez en este estudio y nombrado como PCV2-grupo 3 (aislados en 1980, 1987 y 1990) o bien al PCV2-grupo 2 (aislados en 1993 y 1996). El cambio de PCV2-grupo 2 a 1 fue confirmado a una escala más global utilizando datos del GenBank desde el año 1997 a 2006. El análisis mostró que el cambió tuvo lugar en el año 2003 o antes. Esto podría ser indicativo que el PCV2-grupo 1 es una forma adaptada del PCV2-grupo 2 y posiblemente podría ser más patógeno.