Caracterización genómica de dos aislados chinos del virus del PRRS
Z.Q. Gao, X. Guo and H.C. Yang. Genomic characterization of two Chinese isolates of Porcine respiratory and reproductive syndrome virus. Archives of Virology. Vol. 149 (7). 2004. Pág. 1341-1351.
19-jul-2004 (hace 20 años 4 meses 10 días)Investigadores de la Universidad de Beijing secuenciaron y analizaron el genoma de dos nuevos aislados del virus del PRRS procedentes de China, el HB-1(sh)/2002 y HB-2(sh)/2002.
El tamaño de los genomas fue de 15.411 y 15.373 nucleótidos para HB-1(sh)/2002 y HB-2(sh)/2002 respectivamente. El análisis comparativo con las secuencias de otro aislado chino (BJ-4), del aislado norteamericano VR2332 y del europeo Lelystad (LV) mostró un una identidad compartida del HB-1(sh)/2002 del 89,8% con BJ-4 y VR2332 y sólo del 54,7% con el LV mientras que el HB-2(sh)/2002 compartió una identidad del 89,4% y 89,5% con el BJ-4 y VR2332 respectivamente y del 54,3% con el LV, indicando la relación existente de los dos aislados chinos con el genotipo norteamericano de PRRSV.
El análisis filogenético en base al ORF mostró que los dos nuevos aislados chinos pertenecen al mismo subgrupo genético. Por su parte, el aislado HB-2(sh)/2002 mostró además variaciones en la proteína estructural NSP2 codificada por el ORF1 y la proteína estructural GP3 codificadas por el ORF3 en comparación con otros aislados norteamericanos.
El tamaño de los genomas fue de 15.411 y 15.373 nucleótidos para HB-1(sh)/2002 y HB-2(sh)/2002 respectivamente. El análisis comparativo con las secuencias de otro aislado chino (BJ-4), del aislado norteamericano VR2332 y del europeo Lelystad (LV) mostró un una identidad compartida del HB-1(sh)/2002 del 89,8% con BJ-4 y VR2332 y sólo del 54,7% con el LV mientras que el HB-2(sh)/2002 compartió una identidad del 89,4% y 89,5% con el BJ-4 y VR2332 respectivamente y del 54,3% con el LV, indicando la relación existente de los dos aislados chinos con el genotipo norteamericano de PRRSV.
El análisis filogenético en base al ORF mostró que los dos nuevos aislados chinos pertenecen al mismo subgrupo genético. Por su parte, el aislado HB-2(sh)/2002 mostró además variaciones en la proteína estructural NSP2 codificada por el ORF1 y la proteína estructural GP3 codificadas por el ORF3 en comparación con otros aislados norteamericanos.