Sanhueza JM, Schwartz M, Corzo CA, Kikuti M, Yeske P, Leuwerke B, Schelkopf A, Williams T, Feuerbach S, Johnson C, Toohill E, Tapia-Escarate D, Yang M, Schroeder D, Vilalta C. Assessing the role of sow parity on PRRSv detection by RT-qPCR through weekly processing fluids monitoring in breeding herds. Preventive Veterinary Medicine. 2023; 213: 105854. https://doi.org/10.1016/j.prevetmed.2023.105854.
08-jun-2023 (hace 1 años 6 meses 17 días)El uso de fluidos de procesado para monitorizar el estado del síndrome respiratorio y reproductivo porcino (PRRS) en las granjas de reproductoras ha ganado aceptación en el sector. Sin embargo, se sabe poco sobre la dinámica de detección del virus del PRRS por RT-qPCR en los fluidos de procesado y sobre los factores que pueden contribuir a mantener el virus del PRRS en la granja después de un brote. El objetivo de este estudio fue describir los resultados semanales de la RT-qPCR en fluidos de procesado en granjas de reproductoras tras un brote y evaluar la proporción de resultados positivos de la RT-qPCR entre los grupos de paridad. Se recogieron semanalmente tejidos de procesado de 15 camadas de primer parto, 15 de segundo parto y 15 de tercer parto o más (grupos de paridad) durante entre 19 y 46 semanas en nueve granjas de reproductoras. Los fluidos de procesado se agruparon y se analizaron cada semana mediante RT-qPCR por grupo de paridad. Además, un subconjunto de 743 muestras de fluidos de procesado de camadas que formaban 50 grupos de paridad, como se ha descrito previamente, se sometieron a pruebas de RT-qPCR individuales a nivel de camada. La concordancia entre los resultados de la RT-qPCR de las muestras de fluido de procesado de grupos de paridad (15 camadas) y los resultados basados en pruebas individuales de camada se evaluó mediante el porcentaje global de concordancia, el índice Kappa y la prueba de McNemar. La asociación entre los resultados de la RT-qPCR y el grupo de paridad se evaluó mediante un modelo de ecuaciones de estimación generalizada, tras tener en cuenta los efectos de la semana de muestreo, la estrategia de control del PRRS de la granja (es decir, con reposición vs sin reposición). Se utilizó una estructura de correlación autorregresiva para tener en cuenta los muestreos repetidos dentro de una granja en el tiempo.
La concordancia global fue del 98%, y el índice Kappa de 0,955 (McNemar p = 1,0). La sensibilidad del grupo de paridad que procesa las muestras de fluidos se estimó en un 100% (IC del 95%: 89-100%), mientras que la especificidad se estimó en un 94% (IC del 95%: 71-100%). Aunque las camadas agregadas de primer parto tuvieron de media una mayor proporción de resultados positivos a la RT-qPCR a partir de la semana de brote 25, la proporción no fue significativamente diferente a la observada para las camadas agregadas de segundo parto y tercero o superiores. Además, las granjas que interrumpieron la entrada de cerdas de reposición tuvieron menor probabilidad de positividad en la RT-qPCR del PRRS en comparación con las que continuaron introduciendo cerdas de reposición (OR = 0,35; IC del 95%: 0,16-0,78).
La persistencia del virus del PRRS en los fluidos de procesado no se vio afectada por el efecto de la paridad de la cerda en la mayoría de granjas de reproductoras estudiadas. No se observó desacuerdo entre los resultados de la RT-qPCR de una muestra agregada de 15 camadas y los de camadas individuales. Esta estrategia de pruebas de agregación de camadas puede ser especialmente útil en las últimas fases de un programa de eliminación con baja prevalencia del virus del PRRS.