Análisis filogenético de aislados del PRRSV procedentes de explotaciones del sureste de China entre 2004 y 2007
Hongxia Hu, Xiaoliang Li, Zhanfeng Zhang, Jiangbing Shuai, Ning Chen, Guangqing Liu and Weihuan Fang. Porcine reproductive and respiratory syndrome viruses predominant in southeastern China from 2004 to 2007 were from a common source and underwent further divergence. Archives of Virology. 2009. Vol. 154 (3): 391-398.
02-sep-2009 (hace 15 años 3 meses 20 días)El análisis filogenético de 46 aislados del virus del PRRS procedentes de explotaciones porcinas del sureste de China recogidas entre los años 2004 y 2007 dio como resultado que todos los aislados pertenecían al tipo norteamericano, y la mayoría de ellos se agrupaban en el subgrupo tipo II con una identidad en la secuencia de aminoácidos del 84,1-89,1% respecto a los del subgrupo I que incluye la cepa norteamericana VR-2332.
Se identificaron tres regiones variables que contenían los epítopes A y B en la región N-terminal y que se encontraban bajo selección positiva. Se observaron también, localizadas en las regiones variables, varias mutaciones adicionales en las cepas de los años 2006 y 2007 en el subgrupo II, en comparación con las de años anteriores (2004-2005) en el mismo grupo. Un análisis más detallado reveló que la mayoría de los aislados de PRRSV del subgrupo II prevalentes en la región desde 2004 tenían trece sitios de mutación que les distingue de las cepas del subgrupo I, lo que indica una posible introducción de una determinada cepa de la misma fuente en la región o en otro lugar y antes de 2004. Se encontró una supresión de 29-aa en el fragmento nsp2 en las cepas del PRRSV en 2005, un año antes de que la cepa de PRRSV virulenta se hiciera dominante en China.
El conjunto de resultados obtenidos muestran que las cepas del PRRSV del subgrupo II con una supresión parcial del nsp2 son actualmente prevalentes en el sureste de China.
Se identificaron tres regiones variables que contenían los epítopes A y B en la región N-terminal y que se encontraban bajo selección positiva. Se observaron también, localizadas en las regiones variables, varias mutaciones adicionales en las cepas de los años 2006 y 2007 en el subgrupo II, en comparación con las de años anteriores (2004-2005) en el mismo grupo. Un análisis más detallado reveló que la mayoría de los aislados de PRRSV del subgrupo II prevalentes en la región desde 2004 tenían trece sitios de mutación que les distingue de las cepas del subgrupo I, lo que indica una posible introducción de una determinada cepa de la misma fuente en la región o en otro lugar y antes de 2004. Se encontró una supresión de 29-aa en el fragmento nsp2 en las cepas del PRRSV en 2005, un año antes de que la cepa de PRRSV virulenta se hiciera dominante en China.
El conjunto de resultados obtenidos muestran que las cepas del PRRSV del subgrupo II con una supresión parcial del nsp2 son actualmente prevalentes en el sureste de China.