Económicamente, el circovirus porcino tipo 2 (PCV2) es uno de los virus más importantes que afectan a los cerdos. Da lugar a varias enfermedades llamadas, en su conjunto, enfermedades asociadas al circovirus porcino (PCVD). La primera vacuna frente a PCV2 se comercializó en 2004 y, hoy en día, la mayor parte de cerdos se vacunan. En España, el segundo productor porcino más importante en la UE, hasta el 80% de sus 24 millones de cerdos están vacunados. En Norteamérica la cobertura es aún mayor.
Últimamente nuestro grupo de investigación se ha interesado en cómo la inmunidad inducida por la vacuna puede afectar a la evolución del PCV2. De hecho, resultados publicados recientemente muestran que, actualmente, en las explotaciones porcinas comerciales están circulando diferentes variantes de PCV2 (Kekarainen et al., 2014). Parte de la variabilidad se ha descubierto en diferentes frecuencias y posiciones genómicas de PCV2 entre granjas vacunadas y no vacunadas. Además, muchos cambios de aminoácidos se han localizado en regiones epitópicas, importantes en la activación del sistema inmune, y previamente identificadas por métodos experimentales. En este estudio se aplicó la secuenciación de nueva generación (NGS, por sus siglas en inglés) sobre PCV2, lo que permitió identificar variantes de baja frecuencia. Estas variantes de baja frecuencia no se pueden detectar con los métodos de secuenciación tradicionales, pero pueden jugar un papel relevante en la infección y transmisión del virus y, todavía más importante, en su evolución. La ventaja de la técnica de NGS es la gran cantidad de datos obtenidos. Posteriores análisis bioinformáticos permiten estudios detallados sobre poblaciones virales a nivel de todo el genoma. Estas tecnologías han sido ya aplicadas para comprender mejor la evolución viral en respuesta a la inmunidad y resistencia a fármacos (Grad et al, 2014; Ortega-Prieto et al, 2013; Tsibris et al, 2009).
Entonces, ¿porqué es interesante estudiar la posible evolución causada por la vacuna en el PCV2? Las características de PCV2 que lo hacen adecuado son:
Estructura del virus de PCV2. Representación de la superficie de toda la cápside de PCV2, proyectada a lo largo de un eje triple icosaédrico. El corte transversal triangular corresponde a un capsómero trimérico de proteínas de la capa (inferior derecha) para ilustrar el contexto biológico real del virión. Protein Data Bank ID: 3R0R.
A pesar de que las vacunas de PCV2 muestran altos niveles de eficacia y un excelente retorno de la inversión (Playa y Meng, 2012), no debemos olvidar la variabilidad y la evolución del virus mientras éste persista en poblaciones de cerdos vacunados.