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Según un estudio realizado por varios centros de investigación estadounidenses, los efectos colaterales de la utilización de dosis subterapéuticas de antibióticos en los animales de granja son evidentes y deben ser considerados en los análisis de costo-beneficio.
Los investigadores estudiaron el impacto de los antibióticos sobre la flora intestinal porcina. Utilizaron cerdos en un entorno muy controlado, con una parte de la camada que recibió una dieta que contenía antibióticos para mejorar el rendimiento [clortetraciclina, sulfametazina y la penicilina (conocido como ASP250)] y la otra parte recibió la misma dieta pero sin los antibióticos. Se realizaron análisis filogenéticos, metagenómicos y PCR cuantitativa.
Se observaron cambios en los filotipos bacterianos tras 14 días de tratamiento con antibióticos, con un aumento en las Proteobacteria (1-11%) en los cerdos medicados en comparación con los cerdos no medicados en el mismo momento. Este cambio fue impulsado por un aumento en las poblaciones de Escherichia coli. El análisis del metagenoma mostró que los genes microbianos funcionales relacionados con la producción y conversión de energía se incrementaron en los cerdos alimentados con antibióticos. Los resultados también indican que los genes de resistencia a los antibióticos se encontraban en mayor abundancia y diversidad en el microbioma de los cerdos medicados. Algunos genes enriquecidos, como aminoglucósidos O-Fosfotransferasas, conferían resistencia a antibióticos que no se administraron en este estudio, lo que demuestra el potencial de la selección indirecta de la resistencia a las clases de antibióticos no ingeridos.
Torey Looft, Timothy A. Johnson, Heather K. Allen, Darrell O. Bayles, David P. Alt, Robert D. Stedtfeld, Woo Jun Sul, Tiffany M. Stedtfeld, Benli Chai, James R. Cole, Syed A. Hashsham, James M. Tiedje, and Thad B. Stanton. In-feed antibiotic effects on the swine intestinal microbiome. PNAS 2012 : 1120238109v1-201120238. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1120238109